by duyunzhoudyz
医学论文写作与科研助手:面向中国医生和医学研究生的 32 个 Agent Skills,适用于 Claude Code、Codex,覆盖选题、PubMed 文献检索、中英写作、选刊投稿与审稿修回。Medical writing & research skills.
# Add to your Claude Code skills
git clone https://github.com/duyunzhoudyz/dyz-med-paper-skillsGuides for using ai agents skills like dyz-med-paper-skills.
See how dyz-med-paper-skills compares with popular alternatives.
dyz-med-paper-skills is an open-source ai agents skill for AI coding assistants such as Claude Code, Codex CLI, and ChatGPT, built by duyunzhoudyz. 医学论文写作与科研助手:面向中国医生和医学研究生的 32 个 Agent Skills,适用于 Claude Code、Codex,覆盖选题、PubMed 文献检索、中英写作、选刊投稿与审稿修回。Medical writing & research skills. It has 73 GitHub stars.
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Clone the repository with "git clone https://github.com/duyunzhoudyz/dyz-med-paper-skills" and add it to your Claude Code skills directory (see the Installation section above).
dyz-med-paper-skills is primarily written in Python. It is open-source under duyunzhoudyz on GitHub, so you can review or fork the full source.
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DYZ MedPaper 是一套围绕中国医生与医学研究生科研场景设计的 AI 论文工作流。从科室现有病例和毕业课题出发,用中文梳理研究问题、讨论统计结果,衔接中英文文献与稿件写作,再把导师意见和审稿要求落实到具体修改,帮你把手头材料推进成能讨论、能修改的论文稿。
无论是在临床工作间隙推进课题,还是一边轮转、一边准备毕业论文,都可以从当前最需要解决的一步开始:选题、查文献、写初稿、改讨论、回审稿意见。
把这 32 个技能装进 Claude Code、Codex 或其他支持 Agent Skills 的智能体,就可以用中文交代任务,从眼前最头疼的那一步开始。查看安装方式
按任务进入教程:医学论文写作 · PubMed 文献检索 · 系统综述与 PRISMA · 统计结果解读 · 中英翻译 · 审稿意见回复。
有数据却迟迟定不下选题,结果做出来了却写不出讨论,稿子改了几轮还是说不清亮点——这些都可以成为起点。你把现有材料和想解决的问题交代清楚,助手就能按对应方法帮你往下做。
| 你现在卡在哪 | 它能帮你干什么 | 可以拿到什么 |
|---|---|---|
| 手上有病例数据,不知道能写什么 | 结合临床问题、已有变量和现实条件,梳理可研究的方向,先看缺什么 | 候选选题、可行性判断、需要补的材料 |
| 文献查了一堆,还是理不出头绪 | 设计中英文检索,整理关键研究,比较别人做了什么、你的研究还能回答什么 | 检索方案、文献梳理、值得继续追的问题 |
| 统计结果出来了,不知道怎么讲 | 解释主要结果,区分统计上的差异与临床上的意义,整理图表和结果段落 | 结果解读、图表建议、结果部分草稿 |
| 引言绕来绕去,讨论只会重复结果 | 理顺文章要回答的问题,安排每段写什么,再根据结果和文献起草 | 写作提纲、章节草稿、修改理由 |
| 导师让大改,不知道从哪下手 | 找出最影响文章的问题,定位到段落,排出修改顺序并协助重写 | 问题清单、修改顺序、改写稿 |
| 收到一长串审稿意见 | 拆开每条意见,安排正文修改,起草回复,标清已经改了什么、还差什么 | 逐条回复信、修改位置、待办清单 |
| 写完了,要选刊和整理投稿材料 | 按主题、文章类型、预算和要求筛选期刊,整理摘要、图表与稿件 | 候选期刊及理由、中英文摘要、基础 Word 审阅稿 |
需要做统计时,也能协助讨论分析思路、准备代码和补充分析;先确认具体方案,再在具备相应软件和数据条件的环境里执行。
只想翻译一段、改一版摘要,或者救一救讨论,也可以单独做。你不用先学会 32 个技能的名字。更多说法见常见任务示例。
选题怎么想、结果怎么看、导师为什么说这一段逻辑不顺,都可以用中文来回讨论。先把研究问题和论证讲清楚,再按需要起草中文论文、英文正文或中英文摘要,让语言转换跟着研究思路走。
有什么病例资料、随访够不够、关键指标有没有、还有多少时间,这些都会影响研究能怎么做。它可以从你的临床观察和现有数据开始,帮你把一个大方向收窄到能继续查、能继续讨论的问题。毕业论文、课题文章或投稿,都能把自己的时间、资源和要求一起带进去。
既能围绕 PubMed 等来源查找研究,也能为知网、万方、维普等中文来源设计检索和整理已有记录;实际检索与全文获取仍需相应权限。中文初稿、英文正文、中英文摘要可以接着做,翻译时重点核对数字、术语和结论的分寸。
导师说“创新性不够”“讨论太散”“结果和结论对不上”,可以把原稿和具体意见一起交给助手。先找出问题在哪、哪些材料还缺,再安排修改顺序、协助重写,并解释修改理由,方便下一轮和导师讨论。
把学校的论文要求、目标期刊、版面费预算、时间安排,以及学校或单位认可范围一起提供,助手就能据此整理写作与投稿清单,比较候选期刊并说明理由。具体要求会去核实,查不到的就标出来,方便你和导师一起做决定。
文章写到哪、哪些数字确认了、导师提出了什么、审稿意见还有几条没处理,都可以记在论文项目里。下次继续时,让助手先读这些记录,再接着推进。章节和回复信也能保存在项目里,整理成基础 Word 稿,方便拿给导师和合作者继续改。
整理材料、搭提纲、起草段落、解释改法、整理回复,这些事可以围着同一篇论文连续做。你负责把握研究方向,助手帮你把想法展开成文字,把意见落实到改稿。
比如,材料齐备时可以这样交代:
这是我的结果表、几篇已经核实的文献和讨论初稿。帮我把讨论重写一版:先说清主要发现,再和已有研究比较,最后写临床意义和局限。缺依据的地方单列,用中文告诉我为什么这样改。
这项任务可以落到几份具体内容上:
接下来还可以要求压缩到期刊字数、改写其中一段、翻成英文,或根据审稿意见继续修订。写作方法和示例里可以看到这些工作如何展开。
下面是仓库里的合成教学示例,用来展示处理思路和稿件长什么样。它们不是医生使用反馈,也不是已发表论文。
| 你想看哪一步 | 打开后能看到什么 |
|---|---|
| 有结果,怎么搭起一篇论文 | 从研究问题到主要发现,再到讨论每一段应该写什么 |
| 被拒稿后,先改哪几个问题 | 把问题指出来、排出先后顺序,再安排具体修改 |
| 中文结果段落,怎么翻成英文 | 对照原文和译文,说明哪些内容必须保留、哪些问题需要另外处理 |
| 审稿意见,怎么一条一条回 | 回复怎么写、正文改哪里、未完成的工作怎么记录 |
只有想法,就先聊选题;有结果,就开始写;有初稿,就直接改;收到了审稿意见,就处理修回。
不必从头走一遍所有步骤。可以只完成眼前的一件事,也可以明确交代一组连续任务,让助手在你授权的范围里接着做。需要你拍板的地方,再把具体问题拿出来讨论。
这套方法覆盖观察性研究、随机试验和系统综述等写作场景。研究类型不同,要补的材料、要查的规范也不同。助手会根据现有材料选择下一步,整篇论文不会在一次调用后自动完成。
技能以 Agent Skills 的 SKILL.md 目录形式组织。核心工作流与本地脚本可以随完整技能目录安装到不同宿主;技能发现、工具权限与调用入口由宿主提供。
| 宿主 | 个人级技能目录 | 项目级技能目录 | 显式调用示例 |
|---|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills/ |
.claude/skills/ |
/dyz-med-orchestrator |
| Codex | ~/.agents/skills/ |
.agents/skills/ |
$dyz-med-orchestrator |
| 其他支持 Agent Skills 的智能体 | 以宿主文档为准 | 以宿主文档为准 | 按宿主方式加载或指定技能 |
下面提供本地安装方式。其他智能体需能读取完整技能目录;执行脚本、检索文献和处理文件时,还需提供相应工具。目录规范兼容不等于所有宿主上的运行行为已经验证,具体验证范围见当前状态。
数据提示: 本地脚本运行不代表整个 AI 会话离线。模型服务可能接收会话中提供的内容;请按所在机构要求处理数据,不提交可识别患者信息、医院凭据或未获准材料。
Windows 可先运行 python --version;如果使用 py -3,将后续 python 替换为 py -3。macOS/Linux 通常使用 python3。Python 可从官网安装。
在仓库主页选择 Code → Download ZIP,解压后在该目录打开终端;或使用 Git:
git clone https://github.com/duyunzhoudyz/dyz-med-paper-skills.git
cd dyz-med-paper-skills
Claude Code:
python scripts/install_codex.py --target "~/.claude/skills"
python scripts/install_codex.py --target "~/.claude/skills" --check
Codex:
python scripts/install_codex.py
python scripts/install_codex.py --check
安装器沿用 install_codex.py 文件名,默认目录为 ~/.agents/skills/,也支持通过 --target 指定 Claude Code 或其他宿主的技能目录。上述命令均复制全部 32 个技能及许可文件,成功后显示 PASS、技能数和安装路径。安装器不联网,不安装模型或 R/Python 包,不修改宿主设置、账号或其他技能;同名技能内容有差异时会停止。
其他智能体可使用 --target 指定其文档要求的目录,或按手动安装说明复制完整技能文件夹。
把路径替换为已经存在的论文项目目录。Claude Code 使用:
python scripts/install_codex.py --target "/path/to/my-paper/.claude/skills"
python scripts/install_codex.py --target "/path/to/my-paper/.claude/skills" --check
Codex 使用:
python scripts/install_codex.py --project "/path/to/my-paper"
python scripts/install_codex.py --project "/path/to/my-paper" --check
--project 固定安装到项目的 .agents/skills/;Claude Code 项目请使用上面的 --target。随后在该项目中打开所选智能体。同一宿主的个人级与项目级安装二选一,避免同名重复条目;Windows 路径含空格时保留引号。
在所选智能体中打开论文文件夹,把准备好的材料放进去,然后用平时说话的方式描述需求。不确定先做哪一步,可以说:
请使用 dyz-med-orchestrator,看看这个文件夹里的论文材料,告诉我现在最该解决什么,先帮我把这一步做好。需要补充的材料列出来。
需要显式调用时,Claude Code 使用 /dyz-med-orchestrator,Codex 使用 $dyz-med-orchestrator;其他智能体按其调用方式操作。先看它对任务的理解和材料缺口,再继续写作或修改。
安装自检只能确认文件是否一致,实际技能是否加载还要在所用智能体中核实。遇到问题见下面的安装维护与排查。
带上安装时相同的 --target 或 --project 参数运行 --check,核对路径后重新打开宿主。Claude Code 可输入 /dyz-med-orchestrator;Codex 可用 /skills、$ 或明确指定 $dyz-med-orchestrator。其他智能体使用其技能管理入口。可要求助手说明本轮实际读取了哪个 SKILL.md;仅提及技能名不能证明已加载。参见 Claude Code 技能文档和 Codex 技能文档。
--check 附带的环境探测只检查 Codex、Rscript 和 PyYAML 是否能被发现;它不探测 Claude Code 或其他宿主,也不验证账号、网络、包版本或文档工具是否实际可用。
在新版本源码目录运行安装器,相同内容会跳过。有差异时,先核对是否修改过安装副本,再指定一个尚不存在、位于源码与安装目录之外的备份目录:
python scripts/install_codex.py --upgrade --backup "/path/to/new-backup"
python scripts/install_codex.py --check
以上为 Codex 默认目录示例。Claude Code 或其他自定义目录的升级与自检都须继续带上原来的 --target;Codex 项目级安装继续带相同的 --project。备份包含被替换的旧文件和安装清单;额外文件会保