沁言学术科研论文 Skills 库

学术 / 科研 / 论文写作 / 基金申报 一站式 AI Agent Skills 集合 Academic Research · Paper Writing · Literature Review · Grant Proposal — Skills for AI Coding Agents

面向学术、科研、论文写作、文献检索、基金申报的综合性 AI Skills 集合库，为 Claude Code、Cursor、Codex、Gemini CLI、OpenClaw 等 AI 编程 Agent 提供 183 个开箱即用的学术 Skills，覆盖论文搜索、科学写作、综述撰写、研究计划、国家自然科学基金（NSFC）申报、国家社会科学基金（NSSFC）申报、生物信息、药物发现、临床医学、机器学习、数据分析等 18 个研究领域。一键安装、按需检索、版本可控。

适合谁用：研究生、博士生、青年教师、科研工作者、博士后、申报基金的学者、撰写论文 / 综述 / 研究计划 / 学术海报 / 演示文稿的研究人员；以及需要为团队搭建 AI 科研工作流的高校实验室 / 研究机构。

来源致谢

• K-Dense-AI/claude-scientific-skills — 170+ 科学研究 Skills
• luwill/research-skills — 学术论文 Slide、综述写作、研究计划 Skills
• 沁言学术自研 Skills（论文搜索、论文分析、论文润色、引文搜索、主题分析）

快速开始

一键安装（推荐）

# 安装全部 183 个 Skills（默认安装到 Claude Code）
curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh | bash

按需安装

# 安装某个分类（按编号）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 01          # 论文检索与文献管理
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 05          # 生物信息与基因组学

# 安装单个 Skill
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s scanpy
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s paper-slide-deck

# 安装沁言学术 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-search
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-analysis

以上命令中 .../install.sh 为 https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh 的缩写。

指定工具 & 作用域

# 安装到不同工具
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool cursor
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool codex
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool gemini
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool openclaw

# 安装到当前项目（而非全局）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project -s scanpy

搜索与浏览

curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list           # 列出所有分类
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list-skills     # 列出全部 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search 蛋白质   # 搜索 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search drug

检测更新 & 版本管理

curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --check-update    # 检查是否有新版本
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update           # 更新全部
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update -s scanpy # 更新单个
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update --force   # 强制更新（覆盖本地修改）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --status           # 查看已安装状态
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --version          # 查看脚本版本

Git Clone 安装

git clone https://github.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills.git
cd qinyan-academic-skills
bash install.sh                    # 安装全部
bash install.sh -s scanpy          # 安装单个
bash install.sh -c 05              # 安装分类
bash install.sh --search 论文      # 搜索
bash install.sh --check-update     # 检查更新
bash install.sh --update            # 更新
bash install.sh --help              # 查看帮助

支持的工具

| 工具 | --tool 参数 | 全局安装目录 | 项目级安装目录 | |------|:----------:|-------------|---------------| | Claude Code | claude（默认） | ~/.claude/skills/ | .claude/skills/ | | Cursor | cursor | ~/.cursor/skills/ | .cursor/skills/ | | Codex | codex | ~/.codex/skills/ | .codex/skills/ | | Gemini CLI | gemini | ~/.gemini/skills/ | .gemini/skills/ | | OpenClaw | openclaw | ~/.openclaw/skills/ | .openclaw/skills/ |

Skills 分类目录

| 编号 | 分类 | 数量 | 说明 | |:----:|------|:----:|------| | — | 沁言学术 Skills | 5 | 沁言学术自研：论文搜索、论文分析、论文润色、引文搜索、主题分析 | | 01 | 论文检索与文献管理 | 10 | 论文搜索、文献检索、引用管理、文献数据库 | | 02 | 科学写作与学术交流 | 6 | 论文写作、同行评审、研究计划、综述撰写 | | 03 | 学术演示与可视化 | 9 | 学术海报、演示文稿、科学示意图、数据可视化 | | 04 | 研究方法与科学思维 | 10 | 假设生成、科学头脑风暴、批判性思维、基金申请（含国自然/国社科） | | 05 | 生物信息与基因组学 | 21 | 序列分析、单细胞分析、基因调控网络、变异注释 | | 06 | 化学信息与药物发现 | 12 | 分子操作、虚拟筛选、分子对接、药物化学 | | 07 | 临床医学与精准医疗 | 18 | 临床试验、变异解读、医学影像、临床决策 | | 08 | 蛋白质工程与结构生物学 | 7 | 蛋白质语言模型、结构预测、序列设计 | | 09 | 机器学习与人工智能 | 14 | 深度学习、经典ML、时间序列、贝叶斯方法 | | 10 | 材料科学与物理计算 | 10 | 材料分析、量子计算、天文学、流体仿真 | | 11 | 数据分析与统计建模 | 11 | 统计分析、网络分析、符号数学、数据可视化 | | 12 | 科学数据库 | 22 | 蛋白质/化学/基因组/临床等专业数据库 | | 13 | 实验室自动化与集成 | 9 | 液体处理、实验室信息管理、工作流自动化 | | 14 | 文档处理与数据工具 | 7 | PDF/DOCX/PPTX/XLSX 处理、格式转换 | | 15 | 金融与经济数据 | 6 | SEC 数据、经济数据、市场分析 | | 16 | 地理空间与遥感 | 2 | GIS 分析、卫星遥感、空间统计 | | 17 | 平台与基础设施 | 4 | 云计算、资源管理、合规认证 |

总计：183 个 Skills，18 个分类

Skills 详细列表

沁言学术 Skills

沁言学术自研的 Skills，通过沁言学术 OpenAPI 提供论文搜索、分析、润色等能力。

| Skill | 说明 | |-------|------| | qinyan-paper-search | 沁言学术论文搜索（Google Scholar/PubMed/ArXiv/万方） | | qinyan-paper-analysis | 沁言学术论文深度分析解读 | | qinyan-paper-polish | 沁言学术论文润色与改写 | | qinyan-citation | 沁言学术引文搜索 | | qinyan-topic-analysis | 沁言学术研究主题分析 |

01-论文检索与文献管理

| Skill | 说明 | |-------|------| | bgpt-paper-search | 结构化全文论文搜索（方法、结果、样本量等25+字段） | | biorxiv-database | bioRxiv 预印本数据库 | | citation-management | 引用管理工具 | | literature-review | 文献综述撰写 | | openalex-database | OpenAlex 学术文献数据库 | | parallel-web | 并行网络搜索与摘要生成 | | perplexity-search | AI驱动的实时信息搜索 | | pubmed-database | PubMed 生物医学文献数据库 | | pyzotero | Zotero 文献管理Python接口 | | research-lookup | 研究发现工具 |

02-科学写作与学术交流

| Skill | 说明 | |-------|------| | medical-imaging-review | 医学影像AI综述写作（7阶段系统化工作流） | | paper-2-web | 论文转网页发布 | | peer-review | 同行评审工具 | | research-proposal | PhD研究计划撰写（支持中英文，Nature Reviews学术写作风格） | | scientific-writing | 科学论文写作 | | venue-templates | 学术会议/期刊模板 |

03-学术演示与可视化

| Skill | 说明 | |-------|------| | generate-image | AI图像生成（FLUX.2 Pro） | | infographics | 专业信息图表制作（10类型，8风格） | | latex-posters | LaTeX学术海报 | | markdown-mermaid-writing | Mermaid流程图与文档 | | paper-slide-deck | 论文自动生成演示文稿（17种视觉风格，自动提取图表） | | pptx-posters | PPTX学术海报 | | scientific-schematics | 科学示意图绘制 | | scientific-slides | 科学报告幻灯片 | | scientific-visualization | 科学数据可视化 |

04-研究方法与科学思维

| Skill | 说明 | |-------|------| | consciousness-council | 多视角专家讨论与分析 | | dhdna-profiler | 认知模式与思维特征分析 | | hypothesis-generation | 科学假设生成 | | nsfc-proposal | 国家自然科学基金（NSFC）申请书撰写（青基/优青/杰青，2026版规范） | | nssfc-proposal | 国家社会科学基金（NSSFC）年度项目申请书撰写（重点/一般/青年/西部，2025版规范，含活页匿名化） | | research-grants | 基金申请写作（NSF/NIH/DOE/DARPA/NSTC 海外基金） | | scholar-evaluation | 学者评估 | | scientific-brainstorming | 科学头脑风暴 | | scientific-critical-thinking | 科学批判性思维 | | what-if-oracle | 多分支可能性探索与风险分析 |

05-生物信息与基因组学

| Skill | 说明 | |-------|------| | anndata | 单细胞数据结构 | | arboreto | 基因调控网络推断 | | biopython | 生物序列分析 | | bioservices | 生物信息Web服务（40+数据源） | | cellxgene-census | 单细胞数据集 | | deeptools | 深度测序分析 | | etetoolkit | 进化树分析 | | flowio | 流式细胞术数据处理 | | geniml | 基因组机器学习 | | gget | 基因组数据获取（20+数据库） | | gtars | 基因组区域分析 | | lamindb | 生物数据管理 | | phylogenetics | 系统发育分析 | | pydeseq2 | 差异表达分析 | | pysam | SAM/BAM文件处理 | | scanpy | 单细胞RNA-seq分析 | | scikit-bio | 生物信息统计 | | scvelo | RNA速率分析 | | scvi-tools | 单细胞变分推断 | | tiledbvcf | VCF变异数据库管理 | | zarr-python | 大规模数组存储 |

06-化学信息与药物发现

| Skill | 说明 | |-------|------| | datamol | 分子数据处理 | | deepchem | 药物发现深度学习 | | diffdock | 分子对接预测 | | matchms | 质谱匹配 | | medchem | 药物化学分析 | | molecular-dynamics | 分子动力学模拟 | | molfeat | 分子特征提取 | | pyopenms | 质谱数据处理 | | pytdc | 药物发现基准测试 | | rdkit | 化学信息学工具包 | | rowan | 云端量子化学计算 | | torchdrug | 药物发现图神经网络 |

07-临床医学与精准医疗

| Skill | 说明 | |-------|------| | cbioportal-database | 癌症基因组数据库 | | clinical-decision-support | 临床决策支持 | | clinical-reports | 临床报告生成 | | clinicaltrials-database | 临床试验数据库 | | clinpgx-database | 药物基因组学数据库 | | clinvar-database | 变异致病性数据库 | | cosmic-database | 癌症体细胞突变数据库 | | depmap | 癌细胞系依赖性数据 | | fda-database | FDA药物数据库 | | histolab | 组织病理学分析 | | imaging-data-commons | 医学影像数据库 | | monarch-database | 罕见病数据库 | | neurokit2 | 生理信号处理 | | neuropixels-analysis | 神经电生理分析 | | pathml | 数字病理学 | | pydicom | DICOM影像处理 | | pyhealth | 健康AI工具 | | treatment-plans | 治疗方案设计 |

08-蛋白质工程与结构生物学

| Skill | 说明 | |-------|------| | adaptyv | 蛋白质自动化测试平台 | | alphafold-database | AlphaFold蛋白质结构数据库 | | esm | 蛋白质语言模型 | | glycoengineering | 糖基化工程 | | interpro-database | 蛋白质结构域数据库 | | pdb-database | 蛋白质结构数据库 | | uniprot-database | 蛋白质序列数据库 |

09-机器学习与人工智能

| Skill | 说明 | |-------|------| | aeon | 时间序列分析 | | hypogenic | 假设驱动的AI | | pymc | 贝叶斯统计建模 | | pymoo | 多目标优化 | | pufferlib | 强化学习 | | pytorch-lightning | PyTorch训练框架 | | scikit-learn | 经典机器学习 | | scikit-survival | 生存分析 | | shap | 模型可解释性 | | stable-baselines3 | 强化学习算法 | | timesfm-forecasting | 时间序列预测（Google零样本模型） | | torch-geometric | 图神经网络 | | transformers | Transformer模型 | | umap-learn | 降维可视化 |

10-材料科学与物理计算

| Skill | 说明 | |-------|------| | astropy | 天文学计算 | | cirq | Google量子电路 | | cobrapy | 代谢建模 | | fluidsim | 计算流体力学 | | matlab | MATLAB/Octave数值计算 | | pennylane | 量子机器学习 | | pymatgen | 材料科学分析 | | qiskit | IBM量子计算 | | qutip | 量子系统模拟 | | simpy | 离散事件仿真 |

11-数据分析与统计建模

| Skill | 说明 | |-------|------| | dask | 分布式计算 | | exploratory-data-analysis | 探索性数据分析 | | matplotlib | 绘图库 | | networkx | 网络/图分析 | | plotly | 交互式可视化 | | polars | 高性能数据框 | | seaborn | 统计数据可视化 | | statistical-analysis | 统计分析工作流 | | statsmodels | 统计建模 | | sympy | 符号数学计算 | | vaex | 大数据懒计算 |

12-科学数据库

| Skill | 说明 | |-------|------| | bindingdb-database | 药物-靶标结合亲和力 | | brenda-database | 酶学数据库 | | chembl-database | 生物活性分子数据库 | | datacommons-client | Google数据公共资源 | | drugbank-database