qinyan-academic-skills

Name: qinyan-academic-skills
Author: LeonChaoX

Verified

沁言学术科研论文Skills库 - 177个学术研究Agent Skills的综合集合，涵盖论文检索、科学写作、生物信息、药物发现、临床医学等17个分类

628stars

56forks

Python

Installation

# Add to your Claude Code skills
git clone https://github.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills

Getting Started

Guides for using ai agents skills like qinyan-academic-skills.

Caveman: Cut Claude Token Use by 65%
How agent-side prompt compression works, when to use it, and when not to.
What is an AI Skills Marketplace?
Definitions, how marketplaces work, and how to choose between them in 2026.
Getting Started with AI Skills

Security ReportVerified

Last scanned: 6/2/2026

{
  "issues": [],
  "status": "PASSED",
  "scannedAt": "2026-06-02T08:39:48.538Z",
  "npmAuditRan": true,
  "pipAuditRan": true
}

README.md

Frequently Asked Questions

What is qinyan-academic-skills?

qinyan-academic-skills is an open-source ai agents skill for AI coding assistants such as Claude Code, Codex CLI, and ChatGPT, built by LeonChaoX. 沁言学术科研论文Skills库 - 177个学术研究Agent Skills的综合集合，涵盖论文检索、科学写作、生物信息、药物发现、临床医学等17个分类. It has 628 GitHub stars.

Is qinyan-academic-skills safe to use?

Yes. qinyan-academic-skills passed SkillsLLM's automated security scan — a dependency vulnerability audit plus prompt-injection heuristics — with no high-severity issues. You can read the full report in the Security Report section on this page.

How do I install qinyan-academic-skills?

Clone the repository with "git clone https://github.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills" and add it to your Claude Code skills directory (see the Installation section above).

What programming language is qinyan-academic-skills written in?

qinyan-academic-skills is primarily written in Python. It is open-source under LeonChaoX on GitHub, so you can review or fork the full source.

Are there alternatives to qinyan-academic-skills?

Yes. SkillsLLM lists many other AI Agents skills you can browse and compare side by side. Open the AI Agents category from the badge at the top of this page, or use the Related Skills and comparison links further down to weigh qinyan-academic-skills against similar tools.

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沁言学术科研论文 Skills 库

学术 / 科研 / 论文写作 / 基金申报一站式 AI Agent Skills 集合 Academic Research · Paper Writing · Literature Review · Grant Proposal — Skills for AI Coding Agents

面向学术、科研、论文写作、文献检索、基金申报的综合性 AI Skills 集合库，为 Claude Code、Cursor、Codex、Gemini CLI、OpenClaw 等 AI 编程 Agent 提供 183 个开箱即用的学术 Skills，覆盖论文搜索、科学写作、综述撰写、研究计划、国家自然科学基金（NSFC）申报、国家社会科学基金（NSSFC）申报、生物信息、药物发现、临床医学、机器学习、数据分析等 18 个研究领域。一键安装、按需检索、版本可控。

适合谁用：研究生、博士生、青年教师、科研工作者、博士后、申报基金的学者、撰写论文 / 综述 / 研究计划 / 学术海报 / 演示文稿的研究人员；以及需要为团队搭建 AI 科研工作流的高校实验室 / 研究机构。

来源致谢

K-Dense-AI/claude-scientific-skills — 170+ 科学研究 Skills
luwill/research-skills — 学术论文 Slide、综述写作、研究计划 Skills
沁言学术自研 Skills（论文搜索、论文分析、论文润色、引文搜索、主题分析）

快速开始

一键安装（推荐）

# 安装全部 183 个 Skills（默认安装到 Claude Code）
curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh | bash

按需安装

# 安装某个分类（按编号）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 01          # 论文检索与文献管理
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 05          # 生物信息与基因组学

# 安装单个 Skill
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s scanpy
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s paper-slide-deck

# 安装沁言学术 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-search
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-analysis

以上命令中 .../install.sh 为 https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh 的缩写。

指定工具 & 作用域

# 安装到不同工具
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool cursor
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool codex
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool gemini
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool openclaw
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool opencode

# 安装到当前项目（而非全局）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project -s scanpy

搜索与浏览

curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list           # 列出所有分类
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list-skills     # 列出全部 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search 蛋白质   # 搜索 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search drug

检测更新 & 版本管理

curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --check-update    # 检查是否有新版本
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update           # 更新全部
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update -s scanpy # 更新单个
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update --force   # 强制更新（覆盖本地修改）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --status           # 查看已安装状态
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --version          # 查看脚本版本

Git Clone 安装

git clone https://github.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills.git
cd qinyan-academic-skills
bash install.sh                    # 安装全部
bash install.sh -s scanpy          # 安装单个
bash install.sh -c 05              # 安装分类
bash install.sh --search 论文      # 搜索
bash install.sh --check-update     # 检查更新
bash install.sh --update            # 更新
bash install.sh --help              # 查看帮助

支持的工具

工具	`--tool` 参数	全局安装目录	项目级安装目录
Claude Code	`claude`（默认）	`~/.claude/skills/`	`.claude/skills/`
Cursor	`cursor`	`~/.cursor/skills/`	`.cursor/skills/`
Codex	`codex`	`~/.codex/skills/`	`.codex/skills/`
Gemini CLI	`gemini`	`~/.gemini/skills/`	`.gemini/skills/`
OpenClaw	`openclaw`	`~/.openclaw/skills/`	`.openclaw/skills/`
OpenCode	`opencode`	`~/.config/opencode/skills/`	`.opencode/skills/`

Skills 分类目录

编号	分类	数量	说明
—	沁言学术 Skills	5	沁言学术自研：论文搜索、论文分析、论文润色、引文搜索、主题分析
01	论文检索与文献管理	10	论文搜索、文献检索、引用管理、文献数据库
02	科学写作与学术交流	6	论文写作、同行评审、研究计划、综述撰写
03	学术演示与可视化	9	学术海报、演示文稿、科学示意图、数据可视化
04	研究方法与科学思维	10	假设生成、科学头脑风暴、批判性思维、基金申请（含国自然/国社科）
05	生物信息与基因组学	21	序列分析、单细胞分析、基因调控网络、变异注释
06	化学信息与药物发现	12	分子操作、虚拟筛选、分子对接、药物化学
07	临床医学与精准医疗	18	临床试验、变异解读、医学影像、临床决策
08	蛋白质工程与结构生物学	7	蛋白质语言模型、结构预测、序列设计
09	机器学习与人工智能	14	深度学习、经典ML、时间序列、贝叶斯方法
10	材料科学与物理计算	10	材料分析、量子计算、天文学、流体仿真
11	数据分析与统计建模	11	统计分析、网络分析、符号数学、数据可视化
12	科学数据库	22	蛋白质/化学/基因组/临床等专业数据库
13	实验室自动化与集成	9	液体处理、实验室信息管理、工作流自动化
14	文档处理与数据工具	7	PDF/DOCX/PPTX/XLSX 处理、格式转换
15	金融与经济数据	6	SEC 数据、经济数据、市场分析
16	地理空间与遥感	2	GIS 分析、卫星遥感、空间统计
17	平台与基础设施	4	云计算、资源管理、合规认证

总计：183 个 Skills，18 个分类

Skills 详细列表

沁言学术 Skills

沁言学术自研的 Skills，通过沁言学术 OpenAPI 提供论文搜索、分析、润色等能力。

Skill	说明
qinyan-paper-search	沁言学术论文搜索（Google Scholar/PubMed/ArXiv/万方）
qinyan-paper-analysis	沁言学术论文深度分析解读
qinyan-paper-polish	沁言学术论文润色与改写
qinyan-citation	沁言学术引文搜索
qinyan-topic-analysis	沁言学术研究主题分析

01-论文检索与文献管理

Skill	说明
bgpt-paper-search	结构化全文论文搜索（方法、结果、样本量等25+字段）
biorxiv-database	bioRxiv 预印本数据库
citation-management	引用管理工具
literature-review	文献综述撰写
openalex-database	OpenAlex 学术文献数据库
parallel-web	并行网络搜索与摘要生成
perplexity-search	AI驱动的实时信息搜索
pubmed-database	PubMed 生物医学文献数据库
pyzotero	Zotero 文献管理Python接口
research-lookup	研究发现工具

02-科学写作与学术交流

Skill	说明
medical-imaging-review	医学影像AI综述写作（7阶段系统化工作流）
paper-2-web	论文转网页发布
peer-review	同行评审工具
research-proposal	PhD研究计划撰写（支持中英文，Nature Reviews学术写作风格）
scientific-writing	科学论文写作
venue-templates	学术会议/期刊模板

03-学术演示与可视化

Skill	说明
generate-image	AI图像生成（FLUX.2 Pro）
infographics	专业信息图表制作（10类型，8风格）
latex-posters	LaTeX学术海报
markdown-mermaid-writing	Mermaid流程图与文档
paper-slide-deck	论文自动生成演示文稿（17种视觉风格，自动提取图表）
pptx-posters	PPTX学术海报
scientific-schematics	科学示意图绘制
scientific-slides	科学报告幻灯片
scientific-visualization	科学数据可视化

04-研究方法与科学思维

Skill	说明
consciousness-council	多视角专家讨论与分析
dhdna-profiler	认知模式与思维特征分析
hypothesis-generation	科学假设生成
nsfc-proposal	国家自然科学基金（NSFC）申请书撰写（青基/优青/杰青，2026版规范）
nssfc-proposal	国家社会科学基金（NSSFC）年度项目申请书撰写（重点/一般/青年/西部，2025版规范，含活页匿名化）
research-grants	基金申请写作（NSF/NIH/DOE/DARPA/NSTC 海外基金）
scholar-evaluation	学者评估
scientific-brainstorming	科学头脑风暴
scientific-critical-thinking	科学批判性思维
what-if-oracle	多分支可能性探索与风险分析

05-生物信息与基因组学

Skill	说明
anndata	单细胞数据结构
arboreto	基因调控网络推断
biopython	生物序列分析
bioservices	生物信息Web服务（40+数据源）
cellxgene-census	单细胞数据集
deeptools	深度测序分析
etetoolkit	进化树分析
flowio	流式细胞术数据处理
geniml	基因组机器学习
gget	基因组数据获取（20+数据库）
gtars	基因组区域分析
lamindb	生物数据管理
phylogenetics	系统发育分析
pydeseq2	差异表达分析
pysam	SAM/BAM文件处理
scanpy	单细胞RNA-seq分析
scikit-bio	生物信息统计
scvelo	RNA速率分析
scvi-tools	单细胞变分推断
tiledbvcf	VCF变异数据库管理
zarr-python	大规模数组存储

06-化学信息与药物发现

Skill	说明
datamol	分子数据处理
deepchem	药物发现深度学习
diffdock	分子对接预测
matchms	质谱匹配
medchem	药物化学分析
molecular-dynamics	分子动力学模拟
molfeat	分子特征提取
pyopenms	质谱数据处理
pytdc	药物发现基准测试
rdkit	化学信息学工具包
rowan	云端量子化学计算
torchdrug	药物发现图神经网络

07-临床医学与精准医疗

Skill	说明
cbioportal-database	癌症基因组数据库
clinical-decision-support	临床决策支持
clinical-reports	临床报告生成
clinicaltrials-database	临床试验数据库
clinpgx-database	药物基因组学数据库
clinvar-database	变异致病性数据库
cosmic-database	癌症体细胞突变数据库
depmap	癌细胞系依赖性数据
fda-database	FDA药物数据库
histolab	组织病理学分析
imaging-data-commons	医学影像数据库
monarch-database	罕见病数据库
neurokit2	生理信号处理
neuropixels-analysis	神经电生理分析
pathml	数字病理学
pydicom	DICOM影像处理
pyhealth	健康AI工具
treatment-plans	治疗方案设计

08-蛋白质工程与结构生物学

Skill	说明
adaptyv	蛋白质自动化测试平台
alphafold-database	AlphaFold蛋白质结构数据库
esm	蛋白质语言模型
glycoengineering	糖基化工程
interpro-database	蛋白质结构域数据库
pdb-database	蛋白质结构数据库
uniprot-database	蛋白质序列数据库

09-机器学习与人工智能

Skill	说明
aeon	时间序列分析
hypogenic	假设驱动的AI
pymc	贝叶斯统计建模
pymoo	多目标优化
pufferlib	强化学习
pytorch-lightning	PyTorch训练框架
scikit-learn	经典机器学习
scikit-survival	生存分析
shap	模型可解释性
stable-baselines3	强化学习算法
timesfm-forecasting	时间序列预测（Google零样本模型）
torch-geometric	图神经网络
transformers	Transformer模型
umap-learn	降维可视化

10-材料科学与物理计算

Skill	说明
astropy	天文学计算
cirq	Google量子电路
cobrapy	代谢建模
fluidsim	计算流体力学
matlab	MATLAB/Octave数值计算
pennylane	量子机器学习
pymatgen	材料科学分析
qiskit	IBM量子计算
qutip	量子系统模拟
simpy	离散事件仿真

11-数据分析与统计建模

Skill	说明
dask	分布式计算
exploratory-data-analysis	探索性数据分析
matplotlib	绘图库
networkx	网络/图分析
plotly	交互式可视化
polars	高性能数据框
seaborn	统计数据可视化
statistical-analysis	统计分析工作流
statsmodels	统计建模
sympy	符号数学计算
vaex	大数据懒计算

12-科学数据库

Skill	说明
bindin